📄 evolutionary biology

Predicting barrier architecture and the genomic landscape of differentiation under polygenic divergent selection

यह शोध पत्र मुख्य भूमि-द्वीप मॉडलों (mainland-island models) में यह भविष्यवाणी करने के लिए प्रभावी प्रवासन दरों पर आधारित एक नए विश्लेषणात्मक ढांचे को विकसित और मान्य करता है कि कैसे पॉलीजेनिक विभेदक चयन (polygenic divergent selection), विभेदीकरण के जीनोमिक पैटर्न और प्रजनन अलगाव को आकार देता है, जो जीन प्रवाह के अवरोधों की आनुवंशिक संरचना का अनुमान लगाने के लिए बेहतर उपकरण प्रदान करता है।

Zwaenepoel, A.2026-09-07
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Forecasting viral evolution from phylogenetic trees

यह शोध पत्र antiGen को प्रस्तुत करता है, जो एक मशीन लर्निंग मॉडल है जो SARS-CoV-2, इन्फ्लुएंजा और डेंगू सहित कई रोगजनकों में भविष्य के वायरल उत्परिवर्तनों (म्यूटेशन) का सटीक पूर्वानुमान लगाने के लिए फाइलोजेनेटिक पेड़ों (phylogenetic trees) का लाभ उठाता है, जिससे महामारी की तैयारी और चिकित्सीय विकास को बढ़ावा मिलता है।

Specht, I., Park, S., Chithrananda, S., Driscoll, C. L., Brixi, G., Palacios, J. A., Hie, B. L.2026-09-05
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Assessing the robustness of SNaQ to violations induced by high-level phylogenetic networks

यह अध्ययन गैर-लेवल-1 फाइलोगैनेटिक नेटवर्क पर SNaQ के प्रदर्शन का मूल्यांकन करता है, जो यह प्रकट करता है कि जबकि यह ओवरलैपिंग रेटिकुलेशन (reticulations) के सटीक टोपोलॉजी को पुनर्प्राप्त नहीं कर सकता है, यह विश्वसनीय रूप से सर्कुलर टैक्सोन ऑर्डर्स और सुसंगत ट्री-ऑफ-ब्लब्स (tree-of-blobs) संरचनाओं का अनुमान लगाता है, जो प्रभावी रूप से एक रूढ़िवादी रेगुलराइज़र (conservative regularizer) के रूप में कार्य करता है जो जटिल, ओवरलैपिंग विकासवादी इतिहास के बजाय मजबूत रेटिकुलेशन संकेतों को प्राथमिकता देता है।

JUSTISON, J. A., Ballen, G., Ceja, R., Solis-Lemus, C., Acosta-Cortes, C., Ceja, R.2026-09-04
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A large-scale evaluation of tree shape indices reveals potential pitfalls

यह अध्ययन नए पायथन लाइब्रेरी "treeshapy" का उपयोग करके 4.5 करोड़ से अधिक अनुभवजन्य वृक्षों (empirical trees) पर 54 फाइलोगैनेटिक ट्री शेप इंडेक्स के एक बड़े पैमाने के मूल्यांकन को प्रस्तुत करता है, जो भविष्य के अधिक सतर्क और प्रभावी ट्री शेप विश्लेषणों के मार्गदर्शन के लिए रूट संवेदनशीलता (root sensitivity), आकार निर्भरता (size dependency) और इंडेक्स अतिरेक (index redundancy) जैसी महत्वपूर्ण कमियों को उजागर करता है।

Haeuser, L., Stamatakis, A.2026-09-04
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Ancestral Sequences Cannot be Accurately Reconstructed via Interpolation in a Variational Autoencoder's Latent Space

यह अध्ययन प्रदर्शित करता है कि एपिस्टैटिक इंटरैक्शन (epistatic interactions) को मॉडल करने की वेरिएशनल ऑटोएनकोडर्स (variational autoencoders) की क्षमता के बावजूद, डिकोडिंग प्रक्रिया के दौरान होने वाला उनका अंतर्निहित सूचना नुकसान उन्हें पूर्वज अनुक्रमों (ancestral sequences) को सटीक रूप से पुनर्गठित करने से रोकता है, क्योंकि वे मानक संभावना-आधारित (likelihood-based) और पार्सिमोनी (parsimony) विधियों द्वारा लगातार पीछे छोड़ दी जाती हैं।

Gorstein, E., Tang, M., Bruzzone, H., Solis-Lemus, C.2026-09-01
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Synchronizing speciation, extinction, and dispersal to island paleodynamics through Bayesian phylogenetics in a Hawaiian plant radiation

लेखक TimeFIG प्रस्तुत करते हैं, जो एक बेयसियन फाइलोगैनेटिक ढांचा है जो आनुवंशिक, विस्तार और पुराभौगोलिक डेटा को समाकलित करता है ताकि जीवाश्मों के बिना विचलन समय, पूर्वज श्रेणियों और विविधीकरण दरों का एक साथ अनुमान लगाया जा सके, जिससे यह प्रकट होता है कि द्वीप अलगाव और आयु हवाईयन *Kadua* विकिरण की विकासवादी गतिशीलता को संचालित करते हैं।

Lichter-Marck, I., Swiston, S. K., Mendes, F. K., May, M. R., Neupane, S., Baldwin, B. G., Wood, K., Ronsted, N., Wagner (…)2026-08-31
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Loss of replication and transcription systems accompanying transition to nucleus-dependent replication in Ariadnavirales, a proposed new order in nucleocytoviricot class Megaviricetes

यह अध्ययन 'Sicyoidochytrium minutum' डीएनए वायरस और संबंधित अनुक्रमों की खोज के आधार पर, क्लास 'Megaviricetes' के भीतर एक नए वायरल ऑर्डर, 'Ariadnavirales' की स्थापना का प्रस्ताव करता है, जो अपनी स्वयं की प्रतिकृति (replication) और ट्रांसक्रिप्शन मशीनरी के नुकसान के कारण होस्ट-न्यूक्लियस-निर्भर प्रतिकृति और ट्रांसक्रिप्शन की ओर एक अद्वितीय विकासवादी संक्रमण प्रदर्शित करते हैं।

Yutin, N., Wolf, Y. I., Krupovic, M., Koonin, E. V.2026-08-30
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Utilising nuclear encoded plastid DNA to identify donors of grass-to-grass lateral gene transfer

यह अध्ययन प्रदर्शित करता है कि नाभिकीय-कोडित प्लास्टिड डीएनए (NUPTs) घास-से-घास पार्श्व जीन स्थानांतरण (lateral gene transfer) के विशिष्ट दाता प्रजातियों की प्रभावी ढंग से पहचान कर सकते हैं, जो यह प्रकट करता है कि *Eremochloa attenuata* ने एक पूर्व ज्ञात LGT और एक नव-पहचाने गए NUPT दोनों वाले डीएनए खंड को *Alloteropsis semialata* में सह-स्थानांतरित किया।

Bourne, N. G., Payne, L., Manzi, S., Besnard, G., Vorontsova, M. S., Jobson, R. W., Chomicki, G. S., Dunning, L. T.2026-08-29
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The evolution of family reputation extends indirect reciprocity

यह शोध पत्र प्रदर्शित करता है कि परिवार-आधारित प्रतिष्ठा का विकास 'किन सिलेक्शन' (kin selection) और 'इनडायरेक्ट रेसिप्रोसिटी' (indirect reciprocity) के बीच एक सकारात्मक फीडबैक लूप बनाता है, जिससे उन स्थितियों का विस्तार होता है जिनमें सहयोग को बनाए रखा जा सकता है, विशेष रूप से तब जब अंतःक्रियाएं विरल हों या व्यक्तिगत व्यवहार का अवलोकन करना कठिन हो।

Dos Santos, M., Ohtsuki, H., Mullon, C.2026-08-29
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Resolution of multi-receiver trade-offs in wall lizard colouration

यह अध्ययन प्रदर्शित करता है कि लुसिटानियन वॉल लिज़ार्ड (Lusitanian wall lizards) दूरी-निर्भर रंग-पैटर्न दृश्यता के माध्यम से अपनी प्रजाति के भीतर संचार और शिकारी से बचाव के बीच के संतुलन को हल करते हैं, एक ऐसी रणनीति जिसे मादाओं और छोटे व्यक्तियों में बनाए रखा जाता है लेकिन बड़े नर द्वारा अंतर-प्रजाति संकेतों को प्राथमिकता देने के लिए त्याग दिया जाता है।

Sreelatha, L. B., Abalos, J., Aguilar, P., Tyers, A. M., Nokelainen, O., Boratynski, Z., Carretero, M. A.2026-08-28